* Etienne Birmelé (Laboratoire MAP 5) - MAP5-UMR 8145

Etienne Birmelé (Laboratoire MAP 5)

Statistiques et analyse structurelle de réseaux biologiques

vendredi 11 octobre 2013, 11h00 - 12h00

Salle de réunion, espace Turing


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Les avancées technologiques des dernières décennies ont permis de recueillir en très grande quantité des informations sur les différents acteurs des mécanismes cellulaires (gènes, protéines, etc…), et en particulier sur leurs interactions. L’objet mathématique permettant de représenter ces interactions est le graphe, ou réseau, et l’étude de cet objet a ouvert plusieurs problématiques mathématiques, dont les principales sont:
1) l’inférence ce réseau à partir des données mesurées dans la cellule
2) la modélisation dynamique à l’aide d’équations différentielles, techniquement limitée à de petits réseaux
3) l’étude statistique des réseaux dans leur globalité, via une simplification de la modélisation des interactions.
Je développerai le troisième point dans cet exposé, et plus particulièrement la recherche de motifs dans les réseaux, les motifs étant de petits graphes sur-représentés dans l’observation. Cette recherche nécessite d’aborder la mise au point de modèles aléatoires réalistes pour les graphes et l’étude d’une statistique de comptage de sous-graphes bien choisie. Je présenterai également des perspectives concernant la comparaison de réseaux à l’aide de perturbations.