* Thomas Picchetti (MAP5) - MAP5-UMR 8145

Thomas Picchetti (MAP5)

Détection de gènes dérégulés

jeudi 7 mai 2015, 9h30 - 10h30

Salle de réunion, espace Turing


Des gènes qui n’obéissent plus au contrôle de leurs régulateurs peuvent jouer un rôle important dans un cancer. On cherche donc à identifier des gènes dérégulés dans des échantillons tumoraux.
Connaissant le réseau de régulation, on le représente par un modèle probabiliste graphique. A partir des niveaux d’expression des gènes, on utilise alors un [{{algorithme EM}}->http://fr.wikipedia.org/wiki/Algorithme_esp%C3%A9rance-maximisation] pour apprendre quels gènes sont dérégulés. L’étape « E » est réalisée de façon approchée sur ce modèle graphique grâce à un algorithme dit « Belief Propagation » ou « Sum-Product ».