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Publications

Logiciels et code source

• PyEPRI: A CPU & GPU compatible Python package for Electron Paramagnetic Resonance Imaging. Licence MIT. Code: https://github.com/remy-abergel/pyepri/, documentation: https://pyepri.math.cnrs.fr/.
• Linear-SuperRes: Linear Super-Resolution through Translational Motion. Licence GNU GPL-3.0. Code & documentation: https://github.com/remy-abergel/linear-superres.
• Gammainc: Fast and accurate evaluation of a generalized incomplete gamma function. Licence GNU GPL 3.0. Code & documentation: https://github.com/remy-abergel/gammainc.
• CPSAR-Tools: Complex Pseudo-raw SAR Image Processing Toolbox. Licence GNU GPL 3.0. Code & documentation: https://www.math-info.univ-paris5.fr/~rabergel/softwares/cpsar-tools.zip.
• STV: The Shannon Total Variation. Licence GNU GPL 3.0. Code & documentation: langage C ou Matlab.
• ICE-Poisson: Total Variation Restoration of Images Corrupted by Poisson Noise with Iterated Conditional Expectations. Licence GNU GPL 3.0. Code & documentation: https://www.math-info.univ-paris5.fr/~rabergel/softwares/ice-poisson.zip.
• ASTRE & CUTASTRE: (Accelerated) A contrario Smooth TRajectory Extraction. Licence GNU GPL 3.0. Code & documentation: https://www.math-info.univ-paris5.fr/~rabergel/cutastre.html.

Co-encadrement doctoral ou post-doctoral

• Thèse de Mehdi Boussâa, “méthodes variationnelles pour l’oxymétrie en imagerie par résonance paramagnétique électronique“, thèse débutée en octobre 2020, soutenue en octobre 2024, co-encadrement avec Pr. Sylvain Durand (MAP5) et Dr. Yves Frapart (LCBPT).
• Thèse de Laurent Bidault, “modèles pour la correction d’images thermiques issues de caméras non-refroidies sans shutter“, thèse CIFRE en partenariat avec Lynred, débutée en décembre 2021, co-encadrement avec Pr. Lionel Moisan et Dr. Olivier Harant (Lynred).
• Post-doctorat de Yassine Mhiri, sur le thème de l’imagerie hyperspectrale interférométrique, dans le cadre de l’ANR FuMultiSPOC, octobre 2024 – Septembre 2025, en collaboration avec : Pr. Lionel Moisan et Dr. Andrés Almansa.

Enseignement

UFR de mathématique et d’informatique de l’université Paris Cité

• Cours de Problèmes inverses, Master 2, parcours Mathématiques Modélisation et Apprentissage (responsable du cours): 2018-19 (30h), 2019-20 (30h), 2020-21 (30h), 2022-23 (30h)
• encadrement de projets étudiants sur l’imagerie sous-pixellique: 2019-20 (6h)

IUT de Paris, département Informatique

Cours de première année

• Cours / TP d’analyse numérique: 2013-14 (21h), 2019-20 (7.5h), 2020-21 (7.5h), 2021-22 (7.5h)
• TD théorie des langages: 2018-19 (21h), 2019-20 (10.5h), 2020-21 (10.5h)
• TD théorie des graphes: 2018-19 (21h), 2021-22 (10.5h)
• TD de logique formelle: 2013-14 (21h), 2014-15 (21h), 2015-16 (21h)
• Cours / TP d’algèbre linéaire: 2013-14 (21h), 2014-15 (21h)

Cours de deuxième année

• Méthodes d’optimisation (cours magistraux + TD) : 2022-23 (25.5h), 2023-24 (25.5h), 2024-25 (25.5h)
• supervision de projets étudiants: 2014-15 (10.5h), 2015-16 (10.5h), thèmes : détection de contours dans les images, générateurs de nombres aléatoires, automates et langages
• TP sur les chaînes de Markov (algorithme du “Page rank”): 2014-15 (3h)
• Cours / TP de modélisation numérique (équations de Lotka-Volterra): 2014-15 (10.5h), 2015-16 (10.5h)

L3 MIAGE

• Cours d’introduction à la théorie des jeux (responsable du cours, sujets abordés : jeux simultanés, équilibres de Nash, algorithme du simplexe): 2019-20 (25h), 2020-21 (25h), 2021-22 (25h)

Master Mathématiques, Vision et Apprentissage (MVA)

• encadrement de projet étudiant sur le traitement sous-pixellique des images SAR: 2019-20
• exposé de travaux scientifiques au cours d’imagerie sous-pixellique du Pr. Lionel Moisan: 2019-20 (1.5h), 2020-21 (2h)